在有空调的房间里，气流方向经常变换，气流速度增加，空气热量不断变动这些因素干扰了人体的嗅觉，削弱了人体对空气中病菌、过敏原和异味的反应。由于空调的存在，房间内湿度太低，这就会对人体眼、鼻等处的粘膜产生不利作用。导致粘膜病。有时更因为空调房间里干燥而又温度适宜，病菌和病毒易于在空气中生存空调机的风管、吹风机也适合病菌和病毒生存繁殖，病菌和病毒被空调吹送出来，易于引发较大规模的感染。空调机的噪音也会干扰神经系统。如果设计室内装修的时候，对空调机的安排不科学，这些问题会更突出。使用空调，会使新鲜的空气中臭氧减少。通常低浓度臭氧可抑制细菌繁殖，高浓度臭氧具有消毒作用，而空调居室中臭氧浓度极低或几乎没有，这就增加了空调病的症状。