人的口腔中存在着大量细菌。但是，并非所有的细菌都具有同等致龋力。口腔中致龋的细菌主要有变形链球菌、乳酸杆菌和口腔放线菌。各种致龋菌对牙面有一定的选择性定居。如在窝沟点隙龋中，以变形链球苗和乳酸杆菌最多；平滑面龋以变形接球菌最多；在牙根面龋中最容易找到的是粘性放线茵。

    这些细苗都属于产酸细菌，当它们与食物成分中的碳水化合作用时，就产生酸。这些酸会与牙釉质生反应，使牙釉质表面脱钙、软化，于是就出现了牙洞。细菌在牙齿表面的附着要依靠牙菌斑，它可以看作是细苗的生环境。细菌在此生态环境中生长、繁殖衰亡，并在其中进行复杂的代谢活动。