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原发性痛经病因目前尚未完全明了，没有任何器质性病变，最常见于25岁以下未婚未产的妇女，大多在初潮后6—12月发病，大多到育龄、婚后会缓解，甚至症状消失。
继发性痛经有明确的病因，常见于育龄妇女，特别是30岁后的已婚妇女，其生殖器官发生了器质性病变，妇科检查可发现子宫增大、活动受限、有压痛；附件增粗或片状增厚、有压痛。须到正规医院看医生，通过对症治疗好原发病，才能消除症状。
追寻发病机理
中医认为，痛经是经血不畅、气滞血瘀所致，“不通则痛”是中医最根本的观点。
而西医学认为，痛经的发病机理大致可归纳为以下几个方面：
(1)子宫的过度收缩。
(2)子宫不正常收缩，导致子宫平滑肌缺血，子宫肌肉的缺血又可引起子宫肌肉的痉挛性收缩，从而产生疼痛而出现痛经。
(3)与子宫内膜以及月经血中前列腺素含量升高有关。痛经患者子宫内膜组织中以及经血中的前列腺素含量均明显高于正常妇女。
继发性痛经八大病因
病因一：子宫内膜异位症
病因二：慢性盆腔炎
病因三：子宫肌腺症
病因四：子宫粘膜下肌瘤
病因五：慢性宫颈炎
病因六：盆腔淤血综合征
病因七：生殖道畸形
病因八：子宫颈或宫腔粘连